BLAST mund të përdoret për disa qëllime. Këto përfshijnë identifikimin e specieve, vendndodhjen e domeneve, vendosjen e filogjenisë, hartën e ADN-së dhe krahasimin. Me përdorimin e BLAST, ju mund të identifikoni saktë një specie ose të gjeni specie homologe.
Për çfarë përdoret BLAST?
BLAST është një algoritëm kompjuterik që është i disponueshëm për përdorim në internet në faqen e internetit të Qendrës Kombëtare për Informacionin Bioteknologjik (NCBI), si dhe në shumë site të tjera. BLAST mund të të rreshtojë dhe të krahasojë me shpejtësi një sekuencë të ADN-së pyetëse me një bazë të dhënash të sekuencave, gjë që e bën atë një mjet kritik në kërkimin e vazhdueshëm gjenomik.
Çfarë është teknika BLAST?
Teknika BLAST është një metodë e zgjidhjes së ankesave e zhvilluar nga Albert Barneto . Mnemonikja qëndron për Besoni, Dëgjo, Kërko falje, Kënaqe dhe Falëndero (Tabela 1). 6. Ky artikull përshkruan dobinë e tij në kujdesin ndaj pacientit dhe si një mjet mësimor klinik.
Si funksionon BLAST në ADN?
Si funksionon BLAST? BLAST identifikon sekuenca homologe duke përdorur një metodë heuristike e cila fillimisht gjen përputhje të shkurtra midis dy sekuencave; Kështu, metoda nuk merr parasysh të gjithë hapësirën e sekuencës. Pas ndeshjes fillestare, BLAST përpiqet të fillojë rreshtimet lokale nga këto ndeshje fillestare.
Pse BLAST është më i shpejtë se Fasta?
Për sa i përket kompleksitetit të kohëzgjatjes së algoritmit, BLAST është më i shpejtë se FASTA duke kërkuar vetëm modelet më të rëndësishme nësekuencat. Ndjeshmëria (ose saktësia) e BLAST dhe FASTA priret të jetë e ndryshme për sekuencat e acidit nukleik dhe proteinave (https://www.bioinfo.se/kurser/swell/blasta-fasta.shtml).