Metodat e bazuara në kapjen e konformacionit të kromozomit (3C) zbulojnë organizimin e kromozomeve brenda bërthamës duke përcaktuar afërsinë fizike të çifteve të pikave përgjatë kromatinës. Ato ruajnë ndërveprimet e kromatinës duke ndërlidhur të ndjekura nga fragmentimi, lidhja dhe sekuenca e rajoneve ndërvepruese.
Si funksionon kapja e konformacionit të kromozomeve?
Kapja në çip e konformacionit të kromozomit (4C) kap ndërveprimet ndërmjet një vendi dhe të gjithë lokacioneve të tjera gjenomike. Ai përfshin një hap të dytë të lidhjes, për të krijuar fragmente të ADN-së të vetë-qarkulluara, të cilat përdoren për të kryer PCR inverse. … Në një mikrovarg të vetëm, mund të analizohen rreth një milion ndërveprime.
Çfarë është kapja e konformacionit të kromatinës?
Kapja e konformacionit të kromatinës (3C) është një teknikë e rëndësishme e përdorur për të studiuar strukturën e kromatinës, si dhe bazën për disa teknika të tjera derivatesh. … Protokolli përfshin ndërlidhjen e qelizave formaldehide të ndjekur nga izolimi dhe tretja e kromatinës me një enzimë kufizuese.
Si funksionon sekuenca Hi-C?
Qasja Hi-C zgjeron 3C-Seq për të hartuar kontaktet e kromatinës në gjenomin e gjerë, dhe është aplikuar gjithashtu për studimin e ndërveprimeve të kromatinës në vend. Në këtë metodë, komplekset ADN-proteinë lidhen me formaldehid. Mostra është e fragmentuar dhe ADN-ja nxirret, lidhet dhe tretet me enzima kufizuese.
Çfarë është teknika Hi-C?
Teknika klasike Hi-C përfshin tretje me kufizim të një gjenomi të ndërlidhur me formaldehid me enzima kufizuese specifike të sekuencës, e ndjekur nga mbushja dhe riparimi i skajeve të tretura me përfshirjen e nukleotide të lidhura me biotinën. Fundet e riparuara më pas rilidhen.
