Artefaktet e dimerit të primerit zakonisht ndodhin në një numër i madh cikli i pragut (zakonisht > 35 cikle), që është më i lartë se numri i ciklit të pragut për amplikonin e dëshiruar. Dimerët e primerit rriten ndjeshëm kur shtohet ADN gjenomike heterologe.
Ku do t'i shihni dimerët e primerit në një xhel të ADN-së?
Në PCR të pikës fundore jo sasiore, dimeri i primerit do të shfaqet si një njollë pak a shumë e zbehtë në një xhel agaroze, nën brezin e produktit të interesit.
Si formohen dimerët e primerit?
Dimerët e primerit formohen kur dy abetare lidhen me njëri-tjetrin, në vend të ADN-së së shabllonit, për shkak të rajoneve të komplementaritetit të primerit.
Si i dalloni dimerët e primerit?
Mënyra më e lehtë për të kontrolluar për dimerët primer është për të krahasuar reagimet tuaja me kontrollin tuaj negativ (ujë në vend të ADN-së ose ARN-së). Dimerët e primerit do të formohen ende në kontrollin negativ. Disa grupe primerash kanë më shumë gjasa të formojnë dimerë se të tjerët.
Pse shfaqen dimerët e primerit?
Kryesisht dimerët e primerit shihen për shkak të përqendrimit të lartë të primerit në përzierjen e reaksionit PCR. Ose nëse nuk ka përforcim PCR dhe mund ta shihni në dimer primer në xhelin e agarozës. Nëse jeni në gjendje të shihni produktin PCR, atëherë mund të zvogëloni përqendrimin e primit dhe t'i mbani kushtet e tjera të njëjta.
