Arabinose është një sheqer me pesë karbon që gjendet gjerësisht në natyrë dhe mund të shërbejë si burimi i vetëm i karbonit në shumë baktere. Produktet proteinike nga tre gjene (araB, araA dhe araD) nevojiten për degradimin e arabinozës në anëtarët e familjes Enterobacteriaceae, si E. coli dhe S.
Çfarë u bën arabinoza baktereve?
Kështu kur arabinoza është e pranishme për të ndezur operonin e arabinozës, GFP prodhohet dhe bakteret mund të fluoreshojnë. Pa arabinozë, gjeni GFP nuk shprehet dhe nuk ka fluoreshencë. Pra, duke ndryshuar përbërjen e lëndëve ushqyese, një studiues mund të kontrollojë kur (dhe nëse) ndodh lulëzimi në bakteret e transformuara.
Cili është roli i arabinozës në transformimin bakterial?
Arabinoza vepron si një rregullator alosterik i AraC, duke ndryshuar me cilat vende të ADN-së lidhet dhe si formon një dimer. Mos harroni se arabinoza është sheqeri që katabolizohet nga proteinat e operonit AraBAD. Kur arabinoza shtohet në mjedisin ku jeton E. coli, ajo lidhet fort me AraC.
Pse përdoret arabinoza?
Përdorimi në biologji
Në biologjinë sintetike, arabinoza përdoret shpesh si një ndërprerës i njëanshëm ose i kthyeshëm për shprehjen e proteinave nën Pkeqpromotor në E. coli. Ky ndezje mund të mohohet nga prania e glukozës ose të rikthehet nga shtimi i glukozës në mjedisin e kulturës, e cila është një formë e shtypjes së katabolitit.
Sia ndikon arabinoza në rregullimin dhe shprehjen e gjeneve te bakteret?
Kur arabinoza është e pranishme, araC relakson konfigurimin e ADN-së në mënyrë që transkriptimi të mund të ndodhë, por kur ky karbohidrat mungon, e njëjta proteinë e kufizon ADN-në për të zvogëluar aftësinë e saj për t'u lidhur me ARN polimerazë.
