Në biologjinë molekulare, STRING (Mjeti i Kërkimit për Rikthimin e Gjeneve/Proteinave Ndërvepruese) është një bazë të dhënash biologjike dhe burim ueb i ndërveprimeve të njohura dhe të parashikuara protein-proteinë. … Versioni i fundit 11b përmban informacion për rreth 24, 5 milionë proteina nga më shumë se 5000 organizma.
Cili është qëllimi i bazës së të dhënave STRING?
Baza e të dhënave STRING synon të mbledhë dhe integrojë këtë informacion, duke konsoliduar proteinën e njohur dhe të parashikuar–të dhënat e lidhjes së proteinave për një numër të madh organizmash.
Çfarë është rezultati STRING?
Në STRING, çdo ndërveprim protein-proteinë shënohet me një ose më shumë 'pika'. E rëndësishmja, këto rezultate nuk tregojnë forcën ose specifikën e ndërveprimit. Në vend të kësaj, ata janë tregues të besimit, d.m.th. sa ka gjasa që STRING të gjykojë një ndërveprim të jetë i vërtetë, duke pasur parasysh provat e disponueshme.
Pse ndërveprojnë proteinat?
Ndërveprimet protein-proteinë (PPI) janë kontakte fizike me specifikë të lartë të vendosur midis dy ose më shumë molekulave proteinike si rezultat i ngjarjeve biokimike të drejtuara nga ndërveprimet që përfshijnë forcat elektrostatike, hidrogjenin lidhja dhe efekti hidrofobik.
Çfarë është shoqata funksionale?
përkufizim. Marrëdhënia binare midis entiteteve biologjike kur njëri prej tyre modulon tjetrin për sa i përket funksionit, shprehjes, degradimit ose qëndrueshmërisë së tjetrit dhe marrëdhëniesndërmjet partnerëve nuk mund të konstatohet si i drejtpërdrejtë, kështu që hapat e ndërmjetëm janë në mënyrë implicite.
