Në të kundërt, shumica e ligazave eukariote të ADN-së, së bashku me enzimat arkeale dhe bakteriofag, bien në nën-familjen e dytë; këto enzima përdorin ATP si një kofaktor.
A kërkojnë ligazat ATP?
Përdoren zakonisht dy ligaza të ADN-së. … T4 ligaza kërkon ATP ndërsa E. coli kërkon NAD+ (Nikotinamid adenine dinukleotidi është një koenzimë që përbëhet nga 2 nt të bashkuara përmes grupeve të tyre fosfate). Të dy katalizojnë bashkimin e një grupi 5'-fosfat dhe një grupi 3'-OH për të formuar një lidhje fosfodiesteri.
Pse ligazat kanë nevojë për ATP?
Dy hapat e reaksionit të lidhjes së ADN-së
Vetë reaksioni i lidhjes së ADN-së ka dy hapa bazë. Së pari fundet e ADN-së duhet të përplasen rastësisht dhe të qëndrojnë së bashku aq gjatë sa ligaza të bashkohet me to. … Për të lejuar enzimën të kryejë reaksione të mëtejshme, AMP në zonën aktive të enzimës duhet të plotësohet nga ATP.
Cili janë funksioni i ligazave?
Ligazat e ADN-së luajnë një rol thelbësor në ruajtjen e integritetit gjenomik duke bashkuar thyerjet në shtyllën kurrizore të fosfodiesterit të ADN-së që ndodhin gjatë replikimit dhe rikombinimit, dhe si pasojë e dëmtimit të ADN-së dhe riparimin. Tre gjene njerëzore, LIG1, LIG3 dhe LIG4 kodojnë ligazat e ADN-së të varura nga ATP.
Çfarë janë ligazat a funksionojnë ato në mënyrë aktive apo pasive?
Ligaza e ADN-së është aktive gjatë procesit të replikimit, riparimit dhe rikombinimit të ADN-së. Përdoret gjerësisht në riparimin e një fije flokuprishet në ADN-në e dyfishtë të organizmave të gjallë duke përdorur vargun plotësues të spirales së dyfishtë si shabllon, ndërsa disa forma mund të korrigjojnë në mënyrë specifike dëmtimet e dyfishtë.
